深圳马可波罗足球俱乐部成立于2004年，前身为深圳平安竞技足球俱乐部。俱乐部由深圳特区报业集团与平安保险联合出资成立，旨在打造一支具有国际竞争力的足球俱乐部。
俱乐部的名字“马可波罗”取自意大利著名的探险家马可·波罗。因为马可波罗曾在自己的游记中详细描述了深圳，俱乐部希望以此名字来彰显深圳的历史文化底蕴。
马可波罗足球俱乐部成立后，在2006年获得了中甲联赛冠军，成功升级至中超联赛。
在中超联赛中，马可波罗足球俱乐部一度发挥出色，曾获得2007年足协杯冠军和2009年中超联赛亚军。期间，俱乐部引进了多位巴西外援，包括卡洛斯和森迪等，提升了球队的整体实力。
进入2010年代后，马可波罗足球俱乐部开始陷入低谷。2011年，俱乐部因财务问题遭遇罚分，并最终降级至中甲联赛。
在中甲联赛期间，马可波罗足球俱乐部表现低迷，甚至一度面临解散的危险。在2018年，俱乐部得到深圳市政府的支持，并更名为深圳佳兆业足球俱乐部。
改名后，深圳佳兆业足球俱乐部重整旗鼓，在2019年再次获得中甲联赛冠军，成功重返中超联赛。
重返中超后，深圳佳兆业足球俱乐部继续引进强援，包括西班牙球星卡拉斯科。在2022赛季，俱乐部获得了中超联赛第5名，刷新了队史最佳成绩。
在深圳马可波罗足球俱乐部的发展历程中，有很多不为人知的故事。
经过多年的风雨洗礼，深圳佳兆业足球俱乐部已经成为深圳足球的代表。俱乐部目前拥有年轻且有潜力的阵容，未来发展前景广阔。
在深圳市政府的支持下，深圳佳兆业足球俱乐部有望在未来取得更大的成就，为这座城市带来更多的荣誉。
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