弗赖堡足球俱乐部成立于1904年，最初名为Freiburger Fußballverein 04。在早期，俱乐部主要参加地区联赛。1933年，弗赖堡加入了德甲联赛，并在1940年首次获得升级。俱乐部在德甲联赛中表现不佳，并在1942年降级。
战后，弗赖堡在地区联赛中度过了大部分时间。1971年，俱乐部再次升级到德甲联赛。这次，弗赖堡在德甲联赛中表现得更好，并在1975年获得第五名。俱乐部仍然难以维持在德甲联赛中的位置，并在1978年降级。
1980年代，弗赖堡在乙级联赛中表现出色。1983年，俱乐部升入甲级联赛，并在1986年获得第三名。1990年，弗赖堡再次升级到德甲联赛。自那以后，俱乐部一直在德甲联赛中，成为联赛中稳定的中游球队。
弗赖堡是德甲联赛中一支稳固的中游球队。俱乐部以其坚韧的防守和高水平的进攻而闻名。弗赖堡的主教练是克里斯蒂安·施特赖希，他自2011年以来一直执教球队。目前，弗赖堡队中的一些关键球员包括尼科·施洛特贝克、温琴佐·格里福和罗兰·萨莱伊。
弗赖堡在2022年德甲联赛中排名第六，获得了欧洲协会联赛的资格。俱乐部还进入了2022年德国足协杯半决赛。弗赖堡的未来看起来一片光明，球队有望在未来几年继续保持在德甲联赛中的强劲表现。
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